黄单胞菌属细菌自1883韦克（J.H.Wakker）*报道风信子黄腐病（Xanthomonas hyacinthi）以后一个世纪内， 各地许多病植物上分离到大量的类似细菌。最初归入植物单胞菌属（Phytomonas），后因此属名与原生动物的一个属名相重而被取消。道森（W.J.Dowson）于1939年建立了黄单胞菌属。

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